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IPC qPCR-Quantifizierungskit

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Interne Positivkontrolle (IPC) – 200 Reaktionen. Die IPC dient als Effizienzkontrolle für das DNA-Isolierungsverfahren, stellt die Qualität und Reinheit der isolierten eDNA sicher und hilft, falsch-negative Ergebnisse zu vermeiden.... Mehr anzeigen
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Produktbeschreibung

Alle Sylphium-Probensets enthalten eine interne Positivkontrolle (IPC) in der Konservierungslösung, die sich in der kleinen Spritze des Probensets (SYL009) befindet. Die IPC dient der Effizienzprüfung des DNA-Isolierungsverfahrens, stellt die Qualität und Reinheit der isolierten eDNA sicher und trägt dazu bei, falsch-negative Ergebnisse zu vermeiden. Diese interne Kontrolle besteht aus einem kleinen Stück synthetischer xenobiotischer DNA. Die ausgewählte DNA-Sequenz der Positivkontrolle kommt nicht in Gewässern vor und beeinträchtigt den Nachweis von Zielorganismen nicht. Das IPC-Quantifizierungskit kann separat oder zusammen mit dem eDNA-Isolationskit bestellt werden. Die IPC wird über den FAM-Kanal nachgewiesen. Das IPC-qPCR-Quantifizierungskit wird mit dem neuen eDNA-qPCR-Hotstart-Mix für Umweltproben geliefert.

Kit-Eigenschaften:

Das IPC-qPCR-Quantifizierungskit bietet:

  • Hohe Resistenz gegen hemmende Faktoren. Umwelt-DNA-Extrakte (eDNA) enthalten häufig mehrere qPCR-hemmende Faktoren. Herkömmliche qPCR-Mastermixe reagieren empfindlich auf diese Substanzen.
  • Starkes Fluoreszenzsignal mit geringem Hintergrundrauschen. Isolierte Umweltproben enthalten Rückstände natürlich vorkommender autofluoreszierender Substanzen, die die Messungen stören. Umweltproben benötigen ein starkes Fluoreszenzsignal aus dem Assay, um Hintergrundstörungen zu vermeiden.
  • Höchstmögliche Sensitivität (1 DNA-Kopie pro Reaktion). Umweltwasserproben können sehr geringe Mengen an Ziel-DNA enthalten.
  • 100 % Spezifität. Isolierte DNA aus Umweltproben enthält Milliarden von DNA-Fragmenten von Bakterien, Protozoen, Pflanzen, Tieren usw. Bei der Entwicklung von Primer/Sonde müssen nicht nur Tiere derselben Ordnung (Fische, Amphibien, Reptilien, Säugetiere usw.) berücksichtigt werden, sondern alle bekannten DNA-Sequenzen müssen auf unspezifische Bindung der Primer und Sonde überprüft werden.


Das Kit wurde für die Verwendung mit eDNA-Isolaten entwickelt und optimiert, die mit dem Sylphium Molecular Ecology eDNA Isolation Kit (#SYL002) gereinigt wurden. Andere eDNA-Isolationsmethoden/-Kits können jedoch ebenfalls verwendet werden. Wenn Sie weitere Informationen zur Verwendung der aus anderen Methoden/Kits gewonnenen Isolate benötigen, um zuverlässige Ergebnisse zu erzielen, senden Sie eine E-Mail an [email protected].

Kitinhalt:

  • Positivkontrolle
  • Primer/Sonden-Mix (10x) zum Nachweis von IPC (FAM-Farbstoff)
  • eDNA qPCR-Mastermix:
    • eTaq DNA-Polymerase
    • eTaq qPCR-Mix
    • PCR-Wasser

Das Kit enthält alle Materialien für 200 Reaktionen à 25 µl.

Weitere Informationen finden Sie im vollständigen Methodenvalidierungsbericht und Handbuch (Englisch).

Eigenschaften

Artikelnummer:
SYL113

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